يضم مجمع البحوث التابع لجامعة حمد بن خليفة معهد قطر لبحوث البيئة والطاقة، ومعهد قطر لبحوث الحوسبة، ومعهد قطر لبحوث الطب الحيوي، إضافة إلى إدارة الاتصال بجامعة حمد بن خليفة، وعمليات الجامعة (الموارد البشرية، وتكنولوجيا المعلومات، والمرافق، والتعاقدات).

تعتبر البحوث جزءًا لا يتجزأ من رسالة جامعة حمد بن خليفة في دعم بناء القدرات البشرية في قطر. وتسعى معاهد البحوث الوطنية الثلاثة إلى إيجاد حلول مبتكرة للتحديات الكبرى التي تواجه قطر والمنطقة. وفي معاملها الحديثة والمتطورة، يحقق علماء الجامعة اكتشافات علمية رائدة. ويعكس اسم "بحثي" طابع الفكر والاستكشاف باعتبارهما عنصرين أساسيين في مجال الأبحاث.